Resumo dos Episódios

02. Teto Não Familiar: 
Sem saber nada sobre a unidade 01 Shinji embarca nela para enfrentar o Angel. Logo no começo da batalha a cabeça e o braço esquerdo do eva se danificam. De repente o EVA começa a se controlar sozinho (Esse fato é chamado de Berserk) e destrói o Angel, a comandante Katsuragi fica responsável por Shinji e leva para morar com ele, lá ele conhece o pingüim da Comandante chamado Pen Pen

03. O Telefone que Jamais Toca: 
O curso de treinamento do eva começam e Shinji tem que treinar todo dia depois da escola ele não tem amigos e fica em casa todos os dias depois de treinar,um dia seus colegas de classe descobre que Shinji é o piloto do EVA e ele fica sendo o mais famoso da escola. Mas um deles, um tal de Touji Suzuhara fica um pé atrás com Shinji.

04. O Dilema do Ouriço:
Shinji não quer mais ficar com misato. Ele foge da casa dela e anda por toda Tokyo 3. Quando Shinji se sente só encontra um de seus colegas Kensuke Aida, que lhe oferece um jantar e abrigo, no final Shinji é capturado pelos agentes de segurança da Nerv e decide sair do projeto EVA.

05. Rei Além de Seu Coração: 
Shinji encontra Rei falando com seu pai normalmente e não entende porque Rei pode falar com seu pai como se fossem pai e filho. Ritsuko vai jantar na casa de Misato e da a seguinte função a Shinji, dar a Rei o cartão de acesso para ela entrar na Nerv antes que ele chegasse na central.

06. Confronto em Tokyo-3:
Shinji é ferido na batalha contra um Angel e perde sua auto confiança com os EVAs, numa tentativa desesperada de acabar com o Angel, Misato reúne toda a energia do Japão para fazer um rifle ISSDF FX-1modificada para entrar no campo AT do Angel. Shinji consegue acertar o tiro e vence a batalha e no final do confronto Shinji consegue conversar com Rei que sorri pela primeira vez para ele.

07. A Criação Humana:
Ritsuko e a capitã Katsuragi foram para Tokyo2 ver exposição da industria pesada japonesa solidária. Um novo EVA é apresentado ele é movido a energia nuclear e não precisa de piloto. Logo na apresentação do EVA ele já perde o controle. Misato e Shinji conseguem para-o com muito custo...

08. Asuka Ataca:
O EVA 02 e a sua piloto, que por sinal é muito bonita e deixa todos loucos, são transportados para o Japão pela frota americana chamada acima do arco-íris. Misato traz Shinji, Touji e Kensuke para a frota principal. Eles almoçam com Asuka e o ex-namorado de Misato, Ryouji Kaji que veio de outro quartel general. De repente, Gaghiel aparece e destrói muitos navios. Shinji e Asuka pilotam EVA 02 para derrotar Gaghiel. E com o plano da capitão Katsuragi conseguem vencer o Angel. Kaji foge em um helicóptero e vai para Nerv levar o Adão em forma embrionária para Gendou.

09. Dancem como se Quisessem Vencer: 
Asuka e Shinji tem a missão de combaterem juntos um Angel, na primeira tentativa os dois falham. Misato com a ajuda de Kaji monta uma tática para Shinji e Asuka vencerem o Angel os dois tinham que sincronizarem ao máximo. Os dois conseguem a tão sonhada sincronização e derrotam o Angel.

10. Inferno de Magma:
O instituto de vulcões do Japão encontram um Angel em forma embrionária dentro de um vulcão. Misato exige um alerta A-17 para ter permissão para captura-lo. Asuka usando uma roupa de astronauta tem a missão de captura-lo. Asuka não consegue captura-lo e ele estava quase nascendo. Então Asuka só tem uma solução: matar o Angel com a ajuda de Shinji Asuka consegue acabar com o Angel.
Shinji, Asuka e Misato descansam em um local de águas térmicas, e Misato fala para Asuka: "Não faça os outros sofrerem por seu ódio pessoal."
15 anos atrás Misato foi salva pelo seu pai a quem odiava, depois ele da um grande salto em sua vida entrando para a Nerv para combater os Anjos.

11. Na Escuridão Silenciosa: 
Ritsuko, Maya e Aoba estão na lavanderia para pegar as roupas, no metro eles encontram Fuyutsuki e vão para a central da Nerv, mas a energia da central acaba.
Shinji, Rei e Asuka estão do lado de fora da central, e Hyouga esta pegando as roupas para Misato e vê que um Angel esta na Tokyo3. Shinji e os outros tentam chegar a central a pé,eles entravam e tubos de ventilação corredores estreitos, etc... hyouga pega um carro eleitoral e tenta passar a mensagem no auto-falante, Gendou prepara um lançamento manual dos Evas, os pilotos chegam e preparam para lutar.
Os EVAs fazem tudo manual até o lançamento, eles sobem por um túnel, mas o Angel começa a atacar com acido, os EVAs preparam um ataque simultâneo tendo: Rei iria pegar a arma que Shinji derrubou no fundo do túnel, Shinji atiraria no Angel e Asuka ficaria de proteção contra o ácido, tudo ocorre perfeito e eles destroem o Angel.
Shinji, Rei e Asuka estão em uma pequena montanha com vista da Tokyo3 tudo apagado, Rei fala uma frase:"O homem teme a escuridão, por isso ele a preenche com o fogo".

12. O Valor de um Milagre é...: 
O comitê principal da Seele decide tomar parte no Programa de Instrumentalidade Humana. Um novo Angel ataca Tokyo3 tentando fazer um ataque direto a Nerv, Shinji, Asuka e Rei são mandados para deter que o Angel se colida com a central, a missão era segurar com as próprias mãos o Angel que iria se jogar, tudo ocorre certo. Gendou está na Antártica para pegar a Lança de Longinus e coloca-la na Lilith para interromper a regeneração. 

13. A Invasão do Angel: 
Shinji, Rei e Asuka estão nus e entram nos prototicos para melhorar o sincronia com os EVAs, mas um incidente acontece e abortam o teste, pois no braço direito do Prototico da Rei apareceram uns fungos que seriam o Angel que se aglomeravam em colônias para formar um sistema para a invasão dos Magi. O Angel consegue invadir os Magi mas Ritsuko consegue para por 3 horas o avanço da dominação dos Magis.
Ritsuko descobre que para eliminar o Angel, eles deveriam fazer com que o Angel copiasse um vírus, mas para isso deveriam mexer nos magi. O único Magi que não foi dominado foi o Casper, o ultimo, Ritsuko entra no Magi Casper e descobre um monte de papeis que seriam úteis, Misato pergunta o que são os Magis e Ritsuko fala que cada Magi(Melquior, Balthazar e Casper) eram os aspectos de sua mãe como o "Mulher, Cientista e Mãe".
As três horas se passam e o Angel começa a atacar de novo e ativa a autodestruição da Nerv, Ritsuko começa a digitar e consegue mandar o vírus nos últimos segundos, Misato da um café a Ritsuko e o pessoal da Seele não ficam sabendo sobre o Angel que invadiu a Nerv.

14. Seele lugar para a Alma:
Seele, uma organização secreta que controla a Nerv e o Projeto de Instrumentabilidade Humana. O comitê da Seele segue os Manuscritos do Mar Morto em suas decisões. Seele não podia tolerar falhas como a da última invasão do Angel na Nerv e colocaram Gendou Ikari na corda bamba. Enquanto isso a Nerv fazia testes com a Rei no EVA 01, e sua taxa de sincronização era a mesma do EVA 00 Shinji fez o teste no EVA 00 e sua taxa era menor que no EVA 01, mas o EVA 00 saiu fora de controle e tentou atingir Rei. Mas o teste de re-sincronização de Rei no EVA 00 foi normal.

15. Mentira e Silêncio: 
Ritsuko, Misato e Kaji foram convidados para uma festa de casamento. Depois da festa todos vão a um bar para beber um pouco. Misato exagera um pouco e fica tonta.Misato revela para Kaji por que acabou o namoro a 8 anos atrás, o motivo era por Kaji parecer com o pai dela, assim ela não sabia se odiava ele ou amava ficando confusa preferiu fugir de Kaji.Shinji e Asuka ficam sozinhos na casa de Misato. Shinji encontra com seu pai no tumulo de sua mãe, Shinji tenta conversar com seu pai mas o que consegue é um pequeno papo, logo Gendou vai embora.

16. Doença até a Morte:
Asuka tem ciúme de Shinji por sua taxa de sincronização ser maior do que a dela. Shinji e o EVA 01 é engolido pelo Angel, ele fica triste por não conseguir sair daquele local que era todo branco. Nos últimos momentos antes do sistema de suporte de vida parar de funcionar, Shinji vê sua mãe e EVA 01 entra em berserk e rasga o Angel ao meio.

17. A 4° Criança: 
Em um teste de ativação do EVA 04, em Nevada, Estados Unidos, ocorre uma explosão do EVA 04 levando tudo junto toda a central da Nerv, e todo o pelotão de teste da Nerv para o ar. Na escola do Shinji, Touji é chamado a diretoria, lá ele encontra Ritsuko que o chama para ser a 4º criança, Touji não retorna a aula.

18. O Julgamento da Vida:
Misato e Shinji falam sobre a expulsão do Eva 04, Na escola Touji não conta a Shinji que é o piloto do novo EVA 03, no térreo Touji conversa com Rei, e Hikari pensa que Touji e Rei estão namorando,mas Asuka fala que os dois são patetas. Na casa da Misato Kaji fica com Shinji e Asuka para cuidar deles, pois MIsato saiu para o teste do novo EVA, Shinji pergunta a Asuka sobre o novo piloto e Asuka diz que não sabe. Já na hora de dormir Shinji e Kaji conversa sobre o Gendou, Shinji diz que acha que sabe quase tudo sobre Gendou, mas Kaji nega que Shinji saiba algo sobre Gendou.
No teste do EVA 03 algo dá errado e faz uma explosão. Um Angel invade o EVA 03 que começa a ir para Tokyo-3. Shinji, Rei e Asuka são mandados para deter o EVA 03 mas eles recusam a lutar contra o EVA 03, pois tem um piloto dentro dele. Primeiro foi Asuka ser destruída segundo Rei e por ultimo Shinji que ficou cara a cara com o EVA 03, Shinji recusando a atacar, Gendou pede para desligar os circuitos nervosos do piloto e ligar o cilindro falso, e começa o massacre contra o EVA 03, Shinji pede para parar mas nada acontece. Depois do massacre Misato liga para Shinji pedindo desculpa por não ter dito quem era o piloto do EVA 03, Shinji antes de ouvir o nome do piloto olha para o cilindro do EVA 03 e vê Touji todo ferido e da um grito de raiva...

19. A Luta de um Homem:
Shinji está profundamente desapontado com seu pai. Ele decide desistir de ser piloto do EVA-01. Ao mesmo tempo, o 14º Angel chega em Tokyo3. EVA 02, EVA 00 e Nerv HQ sofrem sérios danos. Zeruel destrói a parede de proteção da Nerv e entra na Sala de Primeiro Comando. Para salvar os membros da Nerv, Shinji decide pilotar o EVA 01 novamente e detém o Angel, mas Shinji se funde com o EVA 01 e sua taxa de sincronia chega a 400%, o Angel é devorado pelo EVA 01.

20. Forma da Mente, Forma do Homem:
Shinji ainda permanece fundido com o EVA 01, já se passo 1 mês. Ritsuko faz planos para tentar salvar o piloto, Misato pergunta se isso já havia acontecido e Ritsuko diz que sim mas não teve sucesso. Shinji entra em uma série de pensamento sobre a sua mãe. Misato começa a tentativa de salvar Shinji, os primeiros comandos são recebidos normalmente mas logo a escotilha de entrada é ejetada, Misato grita o nome de Shinji em uma voz alto, dentro do cilindro Shinji, sem forma ainda, acorda e escuta a voz de Misato chamando-o. Misato vê a roupa de Shinji no chão, ela abraça a roupa e chora, mas de repente Shinji aparece nu no chão ao lado de Misato.

21. O Nascimento da Nerv:
Misato aparece e os guardas da Nerv pede a arma e o cartão da central de Misato, Misato os entrega e pergunta para que isso e eles respondem que o professor Fuyutsuki foi raptado e o principal suspeito era Kaji amante de Misato. Fuyutsuki está em uma sala escura onde o pessoal da Seele conversam, eles perguntam porque Fuyutsuki entrou na Nerv e Fuyutsuki começa a contar a historia da Nerv.
Fuyutsuki era um professor em uma universidade onde sempre ia beber cerveja na beira do lago com os alunos, certo dia Fuyutsuki recebe uma carta de uma garota chamada Ikari sobre biomecânica, ele a recebe na escola e descobre que seu nome completo é Ikari Yui, ela diz que quer ter um filho e por isso não poderia trabalhar muito. Fuyutsuki vai a delegacia para tirar uma pessoa da delegacia é Gendou Rokubunji, Yui diz a Fuyutsuki que estava saindo com Gendou, Fuyutsuki fica triste pois nunca gostou de Gendou. Anos se passam e o segundo impacto acontece, Fuyutsuki encontra Gendou em um barco onde Gendou entrega um cartão de casamento, agora Gendou passou a chamar Gendou Ikari pois ele casou com Yui Ikari.
Fuyutsuki descobre sobre o segundo impacto e pergunta porque a ONU não revelou a existência do gigante de luz(Na verdade esse gigante de luz era Adão, responsável pelo segundo impacto) e sobre a escritura do mar morto, Fuyutsuki diz que vai revelar tudo, mas Gendou pede para ele sigilo, Gendou leva Fuyutsuki até a uma instalação subterrânea, onde encontra doutora Akagi(Mãe de Ritsuko) e Yui, Gendou mostra o humanóide chamada de EVA, pois foi do Adão que eles conseguiram construir o EVA 00, Fuyutsuki fica surpreso e Gendou pergunta se Fuyutsuki não queria fazer parte da equipe,
Fuyutsuki andando pelos corredores encontra uma sala com uma criança é Misato filha do doutor Katsuragi, ela não fala 2 anos. No dia do primeiro teste do EVA 00, Yui leva uma criança a instalação é Shinji, Misato e Ritsuko já estão grandes e são boas amigas, Misato fala tanto, como se quisesse aproveitar os 2 anos que não falou. No teste Yui morre e Gendou muda seu modo de ser e adota uma criança chamada Rei, Shinji fica com os tios. Em uma noite Rei fica perdida no Geofront e Akagi aparece para ajudar mas Rei recusa e pergunta se ela é a bruxa velha que Gendou falava para ela, Akagi fico brava e estrangula Rei e depois se matou.
No tempo atual Misato é liberada e Fuyutsuki é solto por Kaji. Misato volta para casa e percebe que há uma mensagem no telefone, é de Kaji dizendo adeus. Em um lugar estranho aparece Kaji e fala "Vocês estão atrasados" e ouve um som de tiro. 

22. Pelo Menos Seja Humano:
O orgulho de Asuka esta muito ferido por causa das suas ultimas derrotas em batalha. Enquanto isso, o 15º Angel (arael) é localizado entrando na órbita da Terra. Misato ordena Asuka fazer um ataque de longa distancia, mas o Angel faz um ataque com uma luz que invade a mente de Asuka, fazendo ela lembrar da morte de sua mãe. O comandante Ikari ordena Rei que pegue a Lança de Longinus e atire contra o Angel, a lança perfura o campo AT do Angel.

23. Lagrimas:
Rei e EVA 00 são capturados e penetrados por Armisael. Rei, que finalmente percebe que ama Shinji, decidiu sacrificar a si mesma e ao EVA 00 e assim proteger Shinji de ser invadido também. EVA 00 explode, Rei se torna luz e calor que varre Tokyo3 do mapa.Shinji fica muito triste com a morte da Rei, mas logo descobre que ela ainda estava viva. Neste episodio, os segredos de Rei são expostos por Ritsuko.

24. O Mensageiro Final:
Tokyo3 desaparece, Shinji não tem mais nenhum amigo. Quando Shinji está deprimido, aparece um garoto que o admira muito. Seu nome é Kaworu Nagisa. Ele é o novo piloto que veio para substituir Asuka, que está mentalmente doente. Shinji e Kaworu logo se tornam bons amigos. Mas a verdade é cruel, ambos estão destinados à tragédia.Kaworu comandando o EVA 02 desce até o Dogma Central, Shinji com o EVA 01 desce junto, os dois EVAs travam uma batalha, Kaworu segue em frente ao encontro de Adão, mas ele percebe que aquele gigante branco não é Adão e sim Lilith, Shinji consegue derrotar o EVA 02 e segura o Kaworu, esse é os minutos mais compridos, EVA 01 segurando o Tabris, Kaworu pede para que Shinji mate-o para que a humanidade sobreviva, Shinji depois de muitos minutos acaba esmagando Tabris.

25. Fim do Mundo (O início da Instrumentabilidade)
Depois de matar seu amigo, Shinji foi sugado em uma profunda depressão e tristeza. Asuka continua com seus pensamentos de inferioridade, sofrendo muito em sua depressão, totalmente fora de si. Rei que presenciou a morte de Kaworu em cima do Dogma Central, agora desapareceu sem pistas. Misato está tentando confortar a perda de Shinji, mas também está tentando decifrar os segredos que Kaji foi incapaz de descobrir - Coisas que os humanos querem, coisas que apenas Deus pode obter, a verdade sobre tudo. Tudo , acompanhando a vontade e o coração de Shinji, está caminhando para o fim do mundo.

26. A fera que gritou "EU" no coração do Mundo  (A Instrumentabilidade continua)
Agora é 2016a.d. As pessoas estão se perdendo, em outras palavras, a instrumentabilidade da mente humana começou. Entretanto, não há tempo para explicar todo o processo. Shinji está debaixo da luz do holofote a examinarão da sua mente. Um garoto que se odeia, que não tem dó de si mesmo, e é isso que está doendo em seu coração, e a lacuna da Complementação Humana. Ele cria seu próprio mundo, sem a presença dos Evangelions ou da Nerv. Mas finalmente ele percebe o sentido da vida... Não precisa se odiar, ele pode ser alguém, não precisa provar nada pra ninguém! O projeto falhou e todos podem continuar suas vidas. Graças ao meu pai Adeus à minha mãe E para todas as crianças do mundo... Felicidades !!!